הוועדה המיוחדת תדון בפרשת היעלמותם של ילדי תימן, מזרח והבלקן )להלן הפרשה(, ובכלל זה -
בעניינים אלה -
 פיקוח על יישום החלטת הממשלה שכותרתה "חשיפת חומרי ועדת החקירה הממלכתית בעניין
פרשת היעלמותם של ילדים מבין עולי תימן בשנים 1954-1948 " )החלטה מספר 2040 מיום
13.11.2016 ( כפי שבאה לידי ביטוי בין היתר בצו ועדות חקירה )היתר עיון בחומרי ועדת
חקירה(, התשע"ז- 2016 .
 פיקוח על פעילות הממשלה להגיע לחקר האמת בפרשה.
 מסמכים המצויים בארכיון המדינה בנושא הפרשה.
 ריכוז תלונות של משפחות הרואות עצמן קשורות לפרשה.
 מאגר DNA שעניינו התאמה בין קרובי משפחה בקשר לפרשה.
 איתור קברים בהתאם לאמור בפרוטוקולים של ועדת החקירה הממלכתית בעניין פרשת
היעלמותם של ילדים מבין עולי תימן בשנים 1954-1948 , ובוועדות בדיקה נוספות.
הוועדה רשאית לעסוק בחקיקה, ואולם אם תובא חקיקה שעניינה מידע גנטי היא תעבור לוועדת
המדע והטכנולוגיה שהנושא מצוי בסמכותה.
לקראת תום תקופת עבודתה תגיש הוועדה דוח